5月22日开始，上海轨道交通3号线、6号线、10号线、16号线将恢复运营，运营时段均为早上7时到晚上20时，行车间隔约为20分钟。
据悉，此次恢复运营的线路中，3号线连接上海火车站和上海南站枢纽，又贯穿中心城区，并在虹桥路站可换乘10号线；10号线连接虹桥枢纽，贯穿中心城区，在浦东港城路站可换乘6号线；6号线和16号线是服务浦东新区的主要线路。
现场环境消杀方面，按本市交通行业环境清洁消毒的有关要求，在4月底以前，已经完成全网络505座车站、30座基地、8个控制中心以及所有列车、车站空调滤网的消毒。目前，正在按照规范要求，对列车和车站进行日常预防性消毒。
场所码设置方面，已经按照“一站一码”的原则，在全网都已经部署了“场所码”。为方便乘客扫码，在站外出入口、站内通道、安检点、服务中心、自动售票机等醒目位置，目前已经张贴了7000多张场所码，总计将张贴1.2万多张。
